한국농업기술진흥원

종자산업진흥센터

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주요업무

종자산업 메카의 꿈을 실현시킬 종자산업진흥센터를 소개합니다.

분자표지분석

분자표지 분석 개요

분자표지

작물의 특성(예: 크기, 색, 병저항성 등)과 관련된 유전자 지표로서, 재배시험없이 실험실에서 작물 특성 예측 가능

유전자형, 예측형질로 구성된 분자표지 표
유전자형 예측형질
병 저항성 병 저항성
병 감수성 병 감수성

분석 프로세스

작물의 특성(예: 크기, 색, 병저항성 등)과 관련된 유전자 지표로서, 재배시험없이 실험실에서 작물 특성 예측 가능

  • 시료접수
  • 시료접수DNA추출
  • 유전자 증폭
  • 유전자형 판별

주요 분석 내용 및 목표

주요 분석 내용 및 목표
품종판별 유전자 검사로 신속·정확한 품종판별 고효율 첨단 육종 지원으로 육종기간 단축
순도검정 유전자 기반 종자품질검정
분자표지 육종 분자표지 분석으로 우수 계통 조기선발
형질예측 병저항성, 매운맛 등 작물 특성 조기 예측

초고속 SNP 분석 시스템

개요

대립 유전자 특이적 프라이머(Primer)와 형광단(Fluorophore), Forster Resonance Energy Transfer(FRET)-cassettes 를 이용하여 PCR을 통한 단일염기다형성(Single-Nucleotide Polymorphism, SNP)과 삽입-결실(Insertion/Deletion, InDel)을 대용량으로 분석 수행

초고속 SNP 분석 시스템

적용 분야

  • 식물 및 동물들의 DNA 추출
  • 추출한 DNA로 부터 각 개체의 Genotyping을 통한 SNP와 InDel의 유전자형 판별
  • 종자 및 품종개량분야에 적용

특징

  • 모듈화된 시스템으로 분석 절차의 유연성이 높으며 샘플로부터 DNA 추출, 분자표지
  • 시약 분주, 밀봉, PCR 반응 및 데이터 분석 처리 구현
  • 소용량 및 대용량 분자표지분석 : 20~250,000 data points/day KASP™, TaqMan®, Invader® 등 다양한 chemistry에 적용가능

대용량 자동화 샘플 전처리 시스템

개요

로보틱스 기술을 이용하여 샘플 분쇄부터 DNA 추출 까지의 전 과정을 자동적으로 수행하는 대용량 자동화 샘플 전처리 시스템

구성 모듈

대용량 자동화 샘플 전처리 시스템 구성 모듈

대용량 자동화 샘플 전처리 시스템 구성 모듈
번호 모델명 용도
1 Biomek NX liquid handler 시약 및 샘플 분주
2 F7 robotic system 분석 중의 샘플 이동용 로봇
3 Genogrinder 2025 종자 등의 샘플 분쇄
4 MultiDrop combi 시약 분주 장치
5 BB dropper 샘플 분쇄에 필요한 메탈 구슬 분주
6 ABgene ALPS 3000 플레이트 밀봉
7 HIG centrifuge 플레이트 원심분리
8 Momentum software 시스템 통합 및 구동, 제어 소프트웨어
9 Single position incubator 샘플을 용해시키기 위한 고온처리
10 Xpeel 플레이트 커버 제거
11 Carousel, 200M, Lndscp RA 분석 중 플레이트 거치 및 보관

특징

  • 로보틱스 기술을 이용한 전 과정의 자동화로 24시간 무인 가동 가능
  • 대량의 샘플을 고효율로 전처리 - 20,000 샘플/일
  • 최적화된 프로토콜을 이용 한 운영비 절감

자동화 유전자 분석 시스템

자동화 유전자 분석 시스템 표
In-Line Liquid Handling System

In-Line Liquid Handling System

  • DNA 및 분석시약 대량 고속 분주
  • 모델명 : Nexar®
  • 제조사 : Douglas Scientific LLC / USA
High-Throughput Thermal Cycler

High-Throughput Thermal Cycler

  • 대용량 PCR : 230,400 data points
  • 모델명 : Soellex®
  • 제조사 : Douglas Scientific LLC / USA
In-Line Scanning System

In-Line Scanning System

  • 대용량/고속 형광 분석기
  • 모델명 : Araya®
  • 제조사 : Douglas Scientific LLC / USA

개요

본 시스템은 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)을 분석하기 위한 장비로써 대립유전자 특이적 형광 탐침으로 각 개체가 지닌 대립유전자가 증폭시키고 이때 발생하는 형광신호를 인식하여 분자표지를 대량의 샘플을 고속으로 분석

특징

  • 연속적인 폴리머 스트립 어레이(ArrayTape™)을 이용한 대용량/자동화시스템
  • 분자표지 대량/고속 분석 – 230,000 data points/run 다양한 SNP 분석법 지원
  • TaqMan, InvaderPLUS, GTXpress, SensiMix, Klear-Kall, KASP, Invader 등

폴리머 스트립 어레이

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